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伤口愈合实验(Wound healing assay)是一种操作简单、经济实惠的研究细胞迁移/肿瘤侵袭的体外试验方法,在SCI论文中得到了广泛的使用【1】。

如何分析划痕实验结果却令很多人头疼!划痕实验常见的统计指标是统计伤口愈合百分比(Wound healing percentage)和划痕宽度。伤口愈合百分比本质上是一种面积分析,半夏在往期已经给大家分享过30秒搞定划痕面积分析,有兴趣的童鞋可以自行查看!

划痕面积的基本分析步骤为:对划痕图片进行Process -> Smooth平滑后进行Process -> Find Edges寻找边缘,再使用Image -> Adjust -> Threshold,阈值选定后进行划痕面积分析:

手动画线起点和终点欠精确;添加的等距水平线数量有限,得到的平均宽度不准确;工作量大,浪费时间。

01、基础知识准备

(1)灰度值灰度值纯黑为0、纯白为255:

(2)Plot Profile

Plot Profile(快捷键 Ctrl+K)见于Analyze -> Plot Profile,适用于线和矩形选框,表示线段和矩形选框所经过的范围内的灰度变化(荧光强度),如下图:

Plot Profile常用于定性表示荧光共定位【2】与矩形范围内荧光强度变化【3】:

02、划痕宽度分析

(1)划痕面积分析

1. ImageJ打开待分析划痕图片,先通过Image -> Type -> 8-bit将图片格式转化为8-bit灰度图片,再通过Process -> Smooth将图片进行平滑处理,最后点击Process -> Find Edges寻找边缘:

2. Process -> Filters -> Gaussian Blur…Sigma设为6,对图片进行模糊处理:

3. Image -> Adjust -> Threshold,按照自己需要调整适合的阈值,调整合适后点击Apply:

利用对二值化图片进行Plot Profile操作,我们便捷、准确的获取了划痕对应的每一个像素的宽度,这提示我们在日常的科研生活中应该勤于思考、做到举一反三!今天的给大家分享ImageJ高效分析划痕宽度就到此为止了,希望对大家有所帮助!

在科研界的江湖中,流传着一大神器—— ImageJ,堪称数据图像分析处理的“倚天剑”。

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